Науковий відділ займається дослідженням всіх об'єктів SCP, які зберігаються та надходять до Зони, розроблючи заходи протидії та нейтралізації у випадку порушень умов зберігання, а також створює різне обладнання, пристрої, препарати та багато іншого для самої Організації, після чого всі ці розробки передаються виробничому відділу. В Науковому відділі відбирають тільки найвидатніших вчених з найрізноманітніших галузей наук.
Керівник Наукового Відділу
Клас персоналу: B
Рівень доступу: 4
Обов'язки керівника наукового відділу включають контроль за продуктивною та безпечною роботою наукового відділу зони, яку він координує. Керівнику наукового відділу дозволено відвідувати зони здержування, проте категорично заборонено наближатися до камер здержування аномалій. Також прямий контакт з аномаліями будь-якого класу сурово заборонений і може бути наданий лише керівником відділу безпеки або директором Зони.
Має інформацію про аномалії класу Безпечний, Евклід та Кетер, які перебувають у комплексі.
Старший Науковий Співробітник
Клас персоналу: C
Рівень доступу: 3
Старший науковий співробітник є вищим ланком в ієрархії наукового відділу. Керує прикріпленими до його групи науковими співробітниками, розподіляючи їхню роботу над об'єктом, до якого вони класифіковані. Також старших наукових дослідників призначають на кураторство певного об'єкта, який знаходиться в зоні. Зазвичай перебуває в офісній зоні та має право вільно переміщатися по всьому комплексу, якщо це є необхідним. Усвідомлений про всі SCP-об'єкти класу Безпечний, Евклід і Кетер в комплексі.
Науковий Співробітник
Клас персоналу: C
Рівень доступу: 2
Це основний персонал комплексу, головною метою якого є вивчення аномалій та всього, що з ними пов'язано. Володіють інформацією про SCP-об'єкти класу Безпечний та Евклід, при цьому мають деяке уявлення про об'єкти класу Кетер. При виникненні критичної ситуації або при підтвердженні одного з сценаріїв повинні бути евакуйовані, разом з інший персонал.
Асистент-Лаборант
Клас персоналу: C
Рівень доступу: 1
Це працівники на випробувальному терміні, які, як правило, призначаються на період перевірки відданості або перевірки участі в якій-небудь ГОІ. Вони не мають доступу до будь-яких об'єктів, що перебувають в Зоні. Кожен моодший досліник має свого куратора - наукового співробітника на час випробувального терміну. У зв'язку з цим переміщення по зонам можливе лише з куратором або після повідомлення його. (Куратор несе відповідальність заспівробітника, до якого він призначений).
SECURE.CONTAIN.PROTECT.